Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Psma8Q9CWH6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms