Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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