Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms