Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms