Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms