Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms