Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp2Q9CQ73 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms