Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms