Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrbp1Q99PL5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms