Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms