Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms