Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cep41Q99NF3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms