Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms