Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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