Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TrabdQ99JY4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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TrabdQ99JY4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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