Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctu1Q99J10 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctu1Q99J10 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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