Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms