Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smc1bQ920F6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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