Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms