Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms