Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms