Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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