Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms