Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms