Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire2Q8K1S6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire2Q8K1S6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms