Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms