Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms