Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms