Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tshz3Q8CGV9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tshz3Q8CGV9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms