Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hpf1Q8CFE2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hpf1Q8CFE2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hpf1Q8CFE2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hpf1Q8CFE2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hpf1Q8CFE2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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