Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms