Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms