Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms