Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms