Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vash1Q8C1W1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vash1Q8C1W1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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