Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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