Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slx1bQ8BX32 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx1bQ8BX32 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Slx1bQ8BX32 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms