Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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