Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms