Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms