Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms