Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Liat1Q810M6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms