Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms