Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms