Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms