Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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