Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms