Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ckap2lQ7TS74 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms