Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms