Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp3Q7TNH6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms